Das vielfältige Bildungsangebot wurde im Schuljahr 2006/07 mit der Einführung des Kurssystems um eine weitere Facette bereichert: Durch zahlreiche themenspezifisch variable Kursen können die Schülerinnen und Schüler nunmehr interessensbezogene Schwerpunkte setzen. Das vielseitige Bildungsangebot des Stiftsgymnasiums soll ihnen die bestmöglichen Voraussetzungen für die Entfaltung ihrer Begabungen bieten. Die freie, themenbezogene Auswahl und notwendige Selbstorganisation lässt sie „Uni-Luft schnuppern“.